More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5772 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 534 aa  1067    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  41.43 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0164  extracellular solute-binding protein family 5  39.96 
 
 		 550 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 529 aa  192  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 529 aa  184  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1084  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.09 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 532 aa  170  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  28.69 
 
 		 538 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 564 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 532 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 529 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  29.78 
 
 		 522 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 515 aa  156  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.57 
 
 		 550 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  27.81 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 547 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 547 aa  150  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.91 
 
 		 534 aa  148  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 547 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  28.09 
 
 		 533 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 535 aa  143  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.99 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.99 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.99 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.99 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  27.99 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.99 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.64 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.05 
 
 		 563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 533 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.99 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  28.74 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 533 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  26.84 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 535 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 516 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  28.54 
 
 		 530 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.43 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  28.54 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  28.54 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  28.54 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  28.54 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.84 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  28.54 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.71 
 
 		 543 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.66 
 
 		 533 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 546 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.68 
 
 		 535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 489 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 529 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 		 566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 		 523 aa  134  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 556 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.43 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0403  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 559 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  31.59 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 521 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.72 
 
 		 524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 503 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 503 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2113  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.29 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 532 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 538 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  27.75 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 525 aa  121  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 530 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>