More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3088 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 538 aa  1113    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  53.15 
 
 		 534 aa  605  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  39 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 543 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 		 564 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  36.81 
 
 		 547 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.39 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 		 569 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 546 aa  327  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  36.43 
 
 		 547 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 537 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  35.95 
 
 		 536 aa  316  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  36.38 
 
 		 536 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  36.59 
 
 		 536 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  35.83 
 
 		 531 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  34.14 
 
 		 529 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 556 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 		 538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 		 531 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  35.33 
 
 		 531 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  38.41 
 
 		 535 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 529 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  37.53 
 
 		 533 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  33.53 
 
 		 538 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  37.11 
 
 		 533 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.32 
 
 		 533 aa  293  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  37.11 
 
 		 533 aa  293  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  37.32 
 
 		 533 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  37.32 
 
 		 533 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 529 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 529 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 		 529 aa  286  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 518 aa  286  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 489 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 536 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  35.46 
 
 		 533 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.46 
 
 		 533 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.46 
 
 		 533 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.46 
 
 		 533 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.46 
 
 		 533 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.46 
 
 		 533 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.46 
 
 		 533 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  34.38 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 536 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  34.83 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  31.96 
 
 		 528 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  31.96 
 
 		 528 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 529 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  34.37 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  34.37 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  34.37 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.29 
 
 		 563 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  34.37 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  34.37 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  34.16 
 
 		 530 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.16 
 
 		 535 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  34.95 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  34.11 
 
 		 530 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 547 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 532 aa  263  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 531 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  31.57 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.34 
 
 		 540 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 524 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  30.78 
 
 		 522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 522 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 522 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  29.18 
 
 		 522 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 522 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 536 aa  210  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  29.16 
 
 		 523 aa  203  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.65 
 
 		 516 aa  174  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.46 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.46 
 
 		 516 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 516 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 516 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  27.46 
 
 		 516 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.27 
 
 		 516 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  30.96 
 
 		 539 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.8 
 
 		 523 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 		 532 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 501 aa  149  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0716  peptide/oligopeptide/nickel ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 		 541 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 516 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 566 aa  143  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.31 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.31 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>