More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2916 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  65.44 
 
 		 521 aa  711    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  100 
 
 		 522 aa  1055    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  56.66 
 
 		 522 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  53.52 
 
 		 522 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  53.52 
 
 		 522 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  55.58 
 
 		 522 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  50.67 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  45.9 
 
 		 531 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  45.9 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  45.08 
 
 		 529 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  42.49 
 
 		 529 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  40.04 
 
 		 564 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 		 532 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  40.75 
 
 		 531 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 		 518 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  40.97 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  38.9 
 
 		 529 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  39.29 
 
 		 531 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 529 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  39.1 
 
 		 529 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  39.73 
 
 		 543 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  40.75 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  40.75 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  40.75 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  40.75 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  40.75 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  40.55 
 
 		 530 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  38.04 
 
 		 547 aa  363  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  37.66 
 
 		 547 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 533 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 533 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 		 535 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 529 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 529 aa  359  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  40.6 
 
 		 530 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 		 533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 		 528 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  38.9 
 
 		 538 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 533 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 		 533 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  39.02 
 
 		 533 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 547 aa  353  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.04 
 
 		 535 aa  349  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  36.87 
 
 		 550 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 489 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  39.04 
 
 		 535 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.58 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  38.58 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.58 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.58 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.58 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.69 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.58 
 
 		 533 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.39 
 
 		 533 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  33.78 
 
 		 531 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 538 aa  260  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 536 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  30.93 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  30.6 
 
 		 528 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  31.56 
 
 		 523 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 		 528 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 		 538 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 556 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.81 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.46 
 
 		 540 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 536 aa  229  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 		 536 aa  227  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 536 aa  226  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.96 
 
 		 516 aa  191  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 516 aa  191  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  29.96 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.77 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.63 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.43 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 521 aa  170  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 534 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 566 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.81 
 
 		 535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 534 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  23.61 
 
 		 532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.46 
 
 		 520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>