More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1097 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1097  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein, putative  100 
 
 		 518 aa  1062    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 516 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.1 
 
 		 510 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 511 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  26.79 
 
 		 516 aa  150  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.79 
 
 		 516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.6 
 
 		 516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 516 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.65 
 
 		 516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.62 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 534 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.1 
 
 		 516 aa  140  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 		 566 aa  140  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 526 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 556 aa  137  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 510 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  24.52 
 
 		 509 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 529 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 526 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.75 
 
 		 535 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 		 529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 523 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.85 
 
 		 560 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 564 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.02 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.02 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.02 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 528 aa  126  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.81 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 489 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 502 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 533 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1562  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.278775  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.71 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  30.09 
 
 		 533 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.72 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 528 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 549 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.25 
 
 		 526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.23 
 
 		 530 aa  120  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 528 aa  120  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.66 
 
 		 545 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 		 535 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 544 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  35.12 
 
 		 495 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 524 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.17 
 
 		 524 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  26.45 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0716  peptide/oligopeptide/nickel ABC transporter substrate-binding protein  23.79 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  29.91 
 
 		 517 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  33.45 
 
 		 519 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 544 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0853  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 552 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 495 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  26.21 
 
 		 540 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 520 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.39 
 
 		 524 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 520 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 537 aa  113  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2938  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 		 530 aa  113  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  31.8 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.84 
 
 		 507 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>