More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2938 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2948  extracellular solute-binding protein family 5  61.19 
 
 
541 aa  674    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649638  normal  0.755867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2938  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
530 aa  1080    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743642  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  42.57 
 
 
527 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1342  extracellular solute-binding protein family 5  31.39 
 
 
623 aa  230  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.274736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 
515 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 
544 aa  154  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 
544 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
516 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.15 
 
 
535 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.93 
 
 
550 aa  141  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
528 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 
529 aa  133  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.88 
 
 
520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
516 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.92 
 
 
516 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.92 
 
 
516 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.25 
 
 
524 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.92 
 
 
516 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.92 
 
 
516 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 
563 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  26.14 
 
 
516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 
516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.72 
 
 
516 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.69 
 
 
542 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
538 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.05 
 
 
530 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 
528 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 
528 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.2 
 
 
541 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
510 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
518 aa  123  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
526 aa  123  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  27.69 
 
 
564 aa  123  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
545 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 
516 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 
516 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.09 
 
 
545 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.72 
 
 
521 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
556 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
521 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.72 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.72 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.48 
 
 
532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.35 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.72 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.48 
 
 
532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
517 aa  118  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.47 
 
 
532 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 
533 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
509 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.97 
 
 
531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
532 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 
522 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 
508 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 
533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
508 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  26.01 
 
 
526 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
525 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.56 
 
 
509 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
520 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.9 
 
 
524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.72 
 
 
538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.58 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 
555 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
501 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.95 
 
 
535 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
520 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
520 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.71 
 
 
518 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
514 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.75 
 
 
532 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>