More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1855 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 540 aa  1108    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0403  twin-arginine translocation pathway signal  52.26 
 
 		 559 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  36.23 
 
 		 563 aa  323  6e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1562  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 		 556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.278775  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  31.3 
 
 		 524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.77 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.83 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.88 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.6 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 510 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 501 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  29.96 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 532 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 516 aa  150  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.88 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.88 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  26.92 
 
 		 516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 516 aa  148  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.72 
 
 		 516 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 511 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 516 aa  146  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.03 
 
 		 516 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 510 aa  144  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 529 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.08 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 547 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  28.78 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.61 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 501 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 		 509 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 523 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 505 aa  136  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.86 
 
 		 544 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2948  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649638  normal  0.755867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 495 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 525 aa  136  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.32 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.19 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.3 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.37 
 
 		 531 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 543 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 518 aa  134  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  27.81 
 
 		 533 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 542 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 521 aa  134  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 531 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 537 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  27.78 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  27.78 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 547 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.78 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.78 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  27.78 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  27.78 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.78 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.61 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.56 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 589 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.55 
 
 		 542 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 		 514 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 534 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 		 544 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>