More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2948 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2948  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
541 aa  1103    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649638  normal  0.755867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2938  extracellular solute-binding protein family 5  61.19 
 
 
530 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743642  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 
527 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1342  extracellular solute-binding protein family 5  30.52 
 
 
623 aa  220  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.274736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 
515 aa  183  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.72 
 
 
516 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  28.72 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.72 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.51 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.51 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
516 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
526 aa  152  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 
540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0403  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 
559 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
528 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.49 
 
 
541 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 
556 aa  140  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1562  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
556 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.278775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  33.75 
 
 
509 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.51 
 
 
531 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1847  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.068039  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1894  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.567427  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1828  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 
566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
501 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 
501 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.03 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.03 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.03 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  27.53 
 
 
519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
525 aa  131  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.4 
 
 
542 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.72 
 
 
520 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.49 
 
 
550 aa  130  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.84 
 
 
521 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  32.09 
 
 
496 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
496 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.4 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
523 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.18 
 
 
532 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 
528 aa  126  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.35 
 
 
510 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
556 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 
544 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  27.21 
 
 
517 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 
610 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
508 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
526 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 
514 aa  124  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 
544 aa  124  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 
513 aa  124  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.33 
 
 
516 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.53 
 
 
535 aa  123  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.59 
 
 
524 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.41 
 
 
538 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.7 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.05 
 
 
523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
538 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  28.15 
 
 
520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  25.36 
 
 
564 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 
516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
513 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
544 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.98 
 
 
512 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1823  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1870  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1804  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12787  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
520 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
529 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 
509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.56 
 
 
595 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.21 
 
 
518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.59 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
537 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>