More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1326 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 587 aa  1206    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 		 579 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 579 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  34.08 
 
 		 587 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 		 580 aa  276  8e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 595 aa  272  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  32.09 
 
 		 577 aa  269  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 607 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 		 591 aa  261  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  30.31 
 
 		 584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  32.07 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  35.18 
 
 		 581 aa  249  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  30.49 
 
 		 587 aa  247  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  29.7 
 
 		 573 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 584 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 589 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 578 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 589 aa  190  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 638 aa  169  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 658 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.37 
 
 		 540 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 576 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 658 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 		 619 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 622 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 657 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 657 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 664 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 727 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.84 
 
 		 531 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 538 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 728 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 		 640 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.27 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 664 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 643 aa  123  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.39 
 
 		 534 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 655 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  25.05 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.17 
 
 		 546 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 530 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 655 aa  120  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 		 651 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 757 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 		 638 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.39 
 
 		 534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 735 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 526 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.53 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 531 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.97 
 
 		 539 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.72 
 
 		 633 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 540 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.73 
 
 		 542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 618 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 522 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1273  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  21.89 
 
 		 531 aa  114  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0104885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 531 aa  114  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.12 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.34 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.76 
 
 		 671 aa  112  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.41 
 
 		 531 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 559 aa  112  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  22.47 
 
 		 501 aa  111  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 765 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 544 aa  110  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 505 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 563 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 645 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 508 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.74 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 522 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 635 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 633 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 639 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  25.78 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 645 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>