More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3058 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 554 aa  1099    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  47.75 
 
 		 556 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  47.12 
 
 		 556 aa  475  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4683  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 564 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  33.67 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 539 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  34.01 
 
 		 540 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  32.99 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  33.13 
 
 		 534 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  34.22 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  32.76 
 
 		 563 aa  227  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 540 aa  226  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 		 576 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  30.76 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 509 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 580 aa  169  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  33.48 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25.05 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 595 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 586 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 526 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  29.9 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 526 aa  157  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 517 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4018  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 553 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  30.94 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 559 aa  150  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  29.16 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.52 
 
 		 511 aa  144  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 605 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.59 
 
 		 505 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 557 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 495 aa  144  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.66 
 
 		 542 aa  143  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.07 
 
 		 531 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.63 
 
 		 556 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.37 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 531 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.31 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.99 
 
 		 529 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.13 
 
 		 532 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 525 aa  140  7e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 578 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.31 
 
 		 528 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  28.51 
 
 		 532 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.36 
 
 		 511 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.01 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.31 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.23 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.26 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  28.26 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  28.26 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.23 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.11 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.11 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 535 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.02 
 
 		 524 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 515 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.89 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.94 
 
 		 528 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  27.75 
 
 		 532 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 535 aa  136  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.92 
 
 		 532 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 498 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.21 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 584 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 531 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  25 
 
 		 518 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>