More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0247 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  100 
 
 
567 aa  1155    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  63.59 
 
 
575 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  62.97 
 
 
559 aa  717    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  61.8 
 
 
575 aa  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  63.95 
 
 
575 aa  725    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  94.71 
 
 
567 aa  1103    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  64.13 
 
 
575 aa  723    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  63.42 
 
 
555 aa  723    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  64.13 
 
 
575 aa  726    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  98.94 
 
 
566 aa  1145    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  63.03 
 
 
575 aa  737    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  62.5 
 
 
575 aa  728    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  64.31 
 
 
575 aa  724    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  61.97 
 
 
575 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  50.86 
 
 
593 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  41.06 
 
 
579 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  36.16 
 
 
579 aa  362  8e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  36.03 
 
 
580 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  31.34 
 
 
574 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 
573 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 
572 aa  223  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.35 
 
 
546 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.07 
 
 
538 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.33 
 
 
540 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
540 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 
533 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
538 aa  187  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
539 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
526 aa  179  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
591 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.03 
 
 
593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.03 
 
 
593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.03 
 
 
556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.21 
 
 
593 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.21 
 
 
510 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.03 
 
 
593 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.03 
 
 
593 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.03 
 
 
593 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 
553 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.15 
 
 
592 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 
593 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 
607 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
580 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
551 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 
607 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.69 
 
 
542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 
531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
532 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
559 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 
529 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
571 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
571 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
522 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.82 
 
 
511 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 
576 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.49 
 
 
511 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
591 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
527 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.77 
 
 
511 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 
529 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
591 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
535 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
512 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
512 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
512 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
510 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 
565 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
544 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.33 
 
 
520 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  28.11 
 
 
533 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.33 
 
 
510 aa  152  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
536 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
545 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
595 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
555 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
617 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.63 
 
 
562 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 
529 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.09 
 
 
544 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  22.97 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.39 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.04 
 
 
511 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.75 
 
 
535 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
531 aa  148  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 
628 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
608 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
515 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 
516 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.29 
 
 
545 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.54 
 
 
541 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.05 
 
 
516 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.7 
 
 
626 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
512 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>