More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2203 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 531 aa  1064    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.07 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1303  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.173146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1850  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.37 
 
 		 509 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.31 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.42 
 
 		 546 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 541 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 541 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.4 
 
 		 520 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  27.43 
 
 		 575 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  27.43 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 549 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 541 aa  170  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.08 
 
 		 555 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  25.54 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 		 519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 575 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 567 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.61 
 
 		 521 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.24 
 
 		 575 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.61 
 
 		 521 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.88 
 
 		 575 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.61 
 
 		 521 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 521 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 541 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 		 534 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 		 533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.35 
 
 		 567 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 540 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.69 
 
 		 575 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.6 
 
 		 531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.49 
 
 		 575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  26.64 
 
 		 541 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.39 
 
 		 538 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.07 
 
 		 559 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.39 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 		 575 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.13 
 
 		 525 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 547 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.46 
 
 		 580 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  24.46 
 
 		 579 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 575 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 516 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.45 
 
 		 510 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.56 
 
 		 520 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.86 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.39 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.66 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.05 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.86 
 
 		 512 aa  154  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.05 
 
 		 512 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.86 
 
 		 512 aa  153  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.86 
 
 		 512 aa  153  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 509 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.09 
 
 		 516 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  28.21 
 
 		 526 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  27.68 
 
 		 526 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.69 
 
 		 516 aa  150  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.38 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 		 514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  26.69 
 
 		 516 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 511 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 525 aa  148  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 		 516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 510 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.21 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  27.66 
 
 		 532 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.29 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.17 
 
 		 516 aa  144  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.8 
 
 		 540 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 542 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.15 
 
 		 512 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 508 aa  144  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 		 515 aa  143  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>