More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1768 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 579 aa  1174    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  39.15 
 
 		 567 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  40.87 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  37.35 
 
 		 575 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  37.17 
 
 		 575 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  37.84 
 
 		 575 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  38.08 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  37.37 
 
 		 575 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  36.08 
 
 		 579 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  35.11 
 
 		 580 aa  339  7e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.55 
 
 		 575 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.29 
 
 		 575 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  36.29 
 
 		 575 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  35.92 
 
 		 555 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  35.65 
 
 		 559 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 593 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  34.23 
 
 		 573 aa  310  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  30.36 
 
 		 557 aa  230  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.89 
 
 		 592 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 591 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  32.84 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.2 
 
 		 593 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.42 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.57 
 
 		 593 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  31.57 
 
 		 593 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  31.57 
 
 		 593 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.36 
 
 		 593 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.88 
 
 		 546 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 539 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.28 
 
 		 540 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.01 
 
 		 538 aa  173  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.36 
 
 		 535 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 559 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 526 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.4 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.62 
 
 		 510 aa  157  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.9 
 
 		 556 aa  153  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.95 
 
 		 516 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.98 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.28 
 
 		 511 aa  146  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 512 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.35 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 639 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 515 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 519 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.12 
 
 		 541 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.29 
 
 		 542 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  23.47 
 
 		 545 aa  143  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 532 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.29 
 
 		 534 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.98 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 		 580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 		 580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.08 
 
 		 534 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  27.49 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.25 
 
 		 511 aa  141  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.68 
 
 		 511 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  22.87 
 
 		 628 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.41 
 
 		 509 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 532 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.45 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 533 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 592 aa  139  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 565 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 531 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 532 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 531 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5167  4-phytase  28.31 
 
 		 530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  0.719428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5538  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 528 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332617  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 531 aa  137  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 515 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.18 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.18 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>