More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2592 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  74.44 
 
 
578 aa  902    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  62.84 
 
 
584 aa  713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
573 aa  1168    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  52.07 
 
 
589 aa  549  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  49.1 
 
 
589 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 
580 aa  258  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  29.61 
 
 
587 aa  236  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  30.18 
 
 
577 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 
584 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 
607 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 
587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
595 aa  220  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 
607 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
591 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
587 aa  210  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
579 aa  209  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 
577 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
579 aa  207  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 
578 aa  206  9e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
578 aa  202  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 
581 aa  201  3.9999999999999996e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
594 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
638 aa  187  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
565 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.32 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
640 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.97 
 
 
538 aa  174  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 
538 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
551 aa  170  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 
534 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.25 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.08 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  28.95 
 
 
540 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
538 aa  163  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
531 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.08 
 
 
527 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 
631 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 
536 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.92 
 
 
586 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
538 aa  156  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
544 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  28.26 
 
 
576 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
540 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.85 
 
 
534 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.68 
 
 
534 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 
657 aa  153  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.76 
 
 
531 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
657 aa  153  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.01 
 
 
540 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
526 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.84 
 
 
520 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
539 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
534 aa  150  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 
638 aa  150  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 
554 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 
629 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 
645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 
645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.36 
 
 
524 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.79 
 
 
540 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
540 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
528 aa  147  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 
563 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
534 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 
600 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  29.31 
 
 
537 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
664 aa  144  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.32 
 
 
638 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
538 aa  144  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.35 
 
 
532 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
658 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 
544 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 
535 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
658 aa  141  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.51 
 
 
560 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
535 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
527 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.02 
 
 
535 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  27.02 
 
 
535 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  27.02 
 
 
535 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
735 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
589 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.11 
 
 
539 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.17 
 
 
532 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  28.91 
 
 
537 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
535 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27 
 
 
537 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 
509 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.01 
 
 
520 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 
557 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 
655 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
643 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  28.07 
 
 
495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
535 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 
529 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 
635 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>