More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0390 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  97.93 
 
 		 579 aa  1175    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 579 aa  1193    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  64.18 
 
 		 578 aa  734    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  59.93 
 
 		 578 aa  689    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  40.89 
 
 		 587 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  39.35 
 
 		 580 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  38.77 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  38.77 
 
 		 607 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  37.73 
 
 		 584 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  38.56 
 
 		 581 aa  341  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  36.48 
 
 		 595 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  36.22 
 
 		 587 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 594 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 591 aa  326  8.000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  32.48 
 
 		 587 aa  297  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  33.51 
 
 		 577 aa  280  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 		 577 aa  273  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  30.28 
 
 		 589 aa  227  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  30.31 
 
 		 589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 573 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 578 aa  204  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 584 aa  200  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 638 aa  182  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.09 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 524 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.64 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 528 aa  158  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 565 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.96 
 
 		 546 aa  156  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 619 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 540 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 696 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 538 aa  150  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.82 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.8 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 657 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 695 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 657 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 524 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.62 
 
 		 566 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.43 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 536 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 557 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 618 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 536 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.23 
 
 		 515 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 622 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 559 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 537 aa  134  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  24.22 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 575 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.53 
 
 		 532 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 576 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  22.77 
 
 		 563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.17 
 
 		 575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.43 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  23.36 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.71 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.09 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.19 
 
 		 575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  23.17 
 
 		 575 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.09 
 
 		 575 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  22.96 
 
 		 575 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  24.5 
 
 		 558 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 527 aa  127  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  29.86 
 
 		 651 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 529 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 693 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 645 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.19 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 575 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 		 516 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.31 
 
 		 531 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.92 
 
 		 559 aa  124  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 658 aa  124  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 534 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 534 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.36 
 
 		 534 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 664 aa  122  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 517 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  25.95 
 
 		 527 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  30.05 
 
 		 645 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 573 aa  120  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>