More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7228 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 664 aa  1343    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  90.07 
 
 		 643 aa  1090    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  63.05 
 
 		 655 aa  772    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  50.67 
 
 		 639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  50.08 
 
 		 635 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  49.41 
 
 		 635 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 		 633 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  46.03 
 
 		 626 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 		 664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  34.17 
 
 		 638 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 655 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 		 657 aa  291  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.17 
 
 		 633 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  33.05 
 
 		 640 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 		 657 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 658 aa  271  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 658 aa  269  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 655 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 643 aa  260  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 642 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 		 686 aa  233  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 		 641 aa  213  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 645 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.13 
 
 		 671 aa  210  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.18 
 
 		 638 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 735 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  30.47 
 
 		 651 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  29.76 
 
 		 659 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  29.91 
 
 		 645 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 656 aa  200  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 		 765 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 682 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.74 
 
 		 679 aa  189  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 729 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 735 aa  187  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 757 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  30.19 
 
 		 645 aa  180  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 727 aa  161  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 728 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 587 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 693 aa  124  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 573 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 584 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 589 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 		 695 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 696 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 594 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  23.72 
 
 		 695 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 578 aa  96.3  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 591 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 580 aa  95.1  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 584 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 607 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 577 aa  91.3  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 607 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 578 aa  90.1  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.88 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 595 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 638 aa  87.4  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 579 aa  84.3  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 579 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2323  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250322  normal  0.0484761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  21.63 
 
 		 581 aa  79  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 591 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.67 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.01 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 580 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 580 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 581 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.94 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 544 aa  72  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.17 
 
 		 531 aa  72  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.33 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 588 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.43 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.25 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.25 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.25 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 526 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.25 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 		 627 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.76 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.76 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 544 aa  69.7  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  20.45 
 
 		 591 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 571 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 571 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  24.19 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.12 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>