More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1530 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  56.91 
 
 		 728 aa  759    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  56.2 
 
 		 735 aa  742    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  56.46 
 
 		 727 aa  761    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  59.36 
 
 		 729 aa  799    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  75.95 
 
 		 659 aa  1058    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  60.52 
 
 		 735 aa  828    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  62.86 
 
 		 765 aa  888    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 656 aa  1355    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  56.04 
 
 		 757 aa  738    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  32.91 
 
 		 640 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 655 aa  296  9e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  32.1 
 
 		 638 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 655 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 664 aa  277  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 		 643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 658 aa  265  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 658 aa  264  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 657 aa  248  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 642 aa  237  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.78 
 
 		 633 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 645 aa  234  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 651 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 645 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 682 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 635 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 639 aa  218  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 		 635 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 633 aa  200  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 643 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.22 
 
 		 638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 664 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.37 
 
 		 671 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 686 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 		 645 aa  180  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.25 
 
 		 679 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 655 aa  179  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.82 
 
 		 626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 693 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  30.27 
 
 		 695 aa  142  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 696 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 695 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  30.53 
 
 		 580 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 589 aa  137  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 587 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 607 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 607 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 578 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 584 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 591 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 584 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 578 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 594 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.57 
 
 		 587 aa  104  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 577 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 581 aa  100  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 579 aa  94.7  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 		 548 aa  94  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 548 aa  93.6  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.52 
 
 		 540 aa  93.6  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 		 577 aa  93.2  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 629 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 638 aa  91.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.72 
 
 		 520 aa  91.3  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 544 aa  90.9  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 537 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 524 aa  90.1  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 528 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.06 
 
 		 588 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.86 
 
 		 524 aa  87.8  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.05 
 
 		 538 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.93 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  22.35 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.85 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  22.57 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.77 
 
 		 562 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.13 
 
 		 541 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.86 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 562 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 544 aa  79.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.49 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  23.79 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>