More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0631 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 631 aa  1280    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  44.44 
 
 		 629 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  45.63 
 
 		 589 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  41.15 
 
 		 605 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  43.37 
 
 		 596 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  37.77 
 
 		 626 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  37.11 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.33 
 
 		 510 aa  181  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 510 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  29.67 
 
 		 540 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.86 
 
 		 532 aa  170  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 508 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.72 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 550 aa  166  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 		 512 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.08 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1892  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 547 aa  161  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1784  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.24 
 
 		 547 aa  161  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.87 
 
 		 546 aa  161  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.57 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2540  peptide transport periplasmic protein precursor  27.82 
 
 		 548 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 580 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 534 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 544 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 534 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 532 aa  157  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 573 aa  157  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 510 aa  157  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.74 
 
 		 538 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.06 
 
 		 531 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 506 aa  154  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 526 aa  154  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.02 
 
 		 541 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 544 aa  154  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 534 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 559 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 531 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 622 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 573 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  25.36 
 
 		 549 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1285  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.32 
 
 		 540 aa  152  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 542 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 607 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.32 
 
 		 528 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 595 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 607 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01271  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  26.12 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2352  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1408  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.12 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.79 
 
 		 525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  27.81 
 
 		 523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01282  hypothetical protein  26.12 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856831  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2331  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 547 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1530  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.12 
 
 		 547 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.414717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.17 
 
 		 520 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 		 549 aa  148  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1501  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.12 
 
 		 547 aa  148  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.84 
 
 		 525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 589 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 588 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 522 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 526 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1828  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.5 
 
 		 539 aa  147  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.011145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 534 aa  147  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.22 
 
 		 535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 597 aa  146  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.5 
 
 		 539 aa  146  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.101699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01870  hypothetical protein  25.99 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 512 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 541 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 530 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.22 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 619 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  27.39 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  27 
 
 		 531 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 587 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 541 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>