More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3160 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  100 
 
 		 679 aa  1402    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 638 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  28.71 
 
 		 686 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 		 640 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 655 aa  250  6e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 		 645 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 658 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 658 aa  238  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 645 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 		 651 aa  233  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 664 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.43 
 
 		 633 aa  228  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 657 aa  224  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 657 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 655 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 639 aa  220  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 682 aa  209  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 643 aa  207  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  32.5 
 
 		 641 aa  203  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.25 
 
 		 638 aa  203  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.49 
 
 		 671 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 642 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 635 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 635 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 664 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 643 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 729 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 656 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 633 aa  173  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.62 
 
 		 626 aa  167  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 735 aa  165  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 659 aa  164  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 727 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 728 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 757 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 735 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 655 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 589 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 693 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  27.96 
 
 		 695 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 		 696 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 584 aa  130  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 589 aa  122  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 573 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 		 580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 577 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 607 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 607 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 591 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 627 aa  91.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.38 
 
 		 545 aa  91.3  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 587 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 577 aa  90.5  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 584 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 579 aa  89.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 579 aa  88.2  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.06 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 594 aa  83.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.74 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 548 aa  81.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.49 
 
 		 588 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 565 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  21.92 
 
 		 587 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 559 aa  76.6  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  22.49 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  24.57 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  23.27 
 
 		 530 aa  73.2  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.51 
 
 		 562 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  22.77 
 
 		 554 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.67 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 595 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.3 
 
 		 592 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  30.49 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  23.02 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 591 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.53 
 
 		 516 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 559 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.27 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>