More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0398 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  81.57 
 
 		 557 aa  951    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 559 aa  1145    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  43.52 
 
 		 627 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  42.88 
 
 		 597 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  35.82 
 
 		 567 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  35.94 
 
 		 548 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  35.57 
 
 		 548 aa  296  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  33.02 
 
 		 562 aa  290  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 531 aa  286  7e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  34.8 
 
 		 547 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 557 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  33.15 
 
 		 560 aa  279  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  32.17 
 
 		 545 aa  276  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  32.6 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.22 
 
 		 556 aa  266  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  31.01 
 
 		 567 aa  263  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 		 553 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.45 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 551 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.84 
 
 		 551 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 		 579 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 540 aa  238  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 		 569 aa  237  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  29.37 
 
 		 565 aa  231  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 561 aa  217  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  31.5 
 
 		 565 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  31.7 
 
 		 568 aa  210  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 		 576 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.06 
 
 		 564 aa  196  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  30.33 
 
 		 572 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.42 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.11 
 
 		 609 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 609 aa  177  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 560 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 636 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.66 
 
 		 563 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 604 aa  161  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 604 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 587 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 580 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 		 645 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  27.69 
 
 		 605 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.58 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.91 
 
 		 562 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 552 aa  136  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.69 
 
 		 577 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 559 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.18 
 
 		 525 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 544 aa  133  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 540 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.49 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 516 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 533 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.34 
 
 		 532 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 		 631 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 633 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 		 502 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  24.87 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 619 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 551 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.88 
 
 		 542 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 618 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 524 aa  124  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 509 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 539 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 579 aa  123  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.51 
 
 		 542 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  25.11 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.52 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 522 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.68 
 
 		 544 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 544 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 622 aa  120  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.95 
 
 		 546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.32 
 
 		 517 aa  117  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.22 
 
 		 589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 531 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 544 aa  117  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 534 aa  116  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.56 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>