More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2397 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  56.54 
 
 
627 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
597 aa  1222    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  43.01 
 
 
557 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  42.22 
 
 
559 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
531 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  35.45 
 
 
567 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  35 
 
 
557 aa  327  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  35.08 
 
 
545 aa  322  9.000000000000001e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  35.93 
 
 
548 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 
551 aa  313  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  35.37 
 
 
548 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.03 
 
 
551 aa  307  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 
562 aa  300  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  36.91 
 
 
560 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  36.26 
 
 
560 aa  293  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  36.5 
 
 
567 aa  283  8.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  34.91 
 
 
556 aa  281  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 
553 aa  280  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 
576 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
554 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  32.95 
 
 
579 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  32.68 
 
 
547 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  31.8 
 
 
561 aa  260  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.97 
 
 
552 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 
569 aa  251  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  30.07 
 
 
565 aa  246  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  34.79 
 
 
568 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  31.29 
 
 
565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 
560 aa  223  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.59 
 
 
564 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 
540 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  29.93 
 
 
609 aa  200  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
604 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
604 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 
559 aa  197  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.31 
 
 
563 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.02 
 
 
609 aa  194  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  31.05 
 
 
572 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.04 
 
 
563 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
576 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
557 aa  174  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
557 aa  174  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
580 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
560 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 
645 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 
568 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  29.94 
 
 
605 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
636 aa  163  9e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  30.2 
 
 
587 aa  161  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
579 aa  158  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.19 
 
 
532 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  29.09 
 
 
577 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.97 
 
 
539 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.41 
 
 
524 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 
629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
544 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
631 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  28.15 
 
 
528 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.53 
 
 
524 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 
536 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.48 
 
 
520 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
531 aa  136  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.35 
 
 
527 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.19 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.29 
 
 
560 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.87 
 
 
542 aa  134  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
510 aa  134  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
552 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.6 
 
 
534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 
522 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.6 
 
 
587 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
523 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.68 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.19 
 
 
525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.7 
 
 
589 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
510 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.41 
 
 
626 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
600 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
533 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
511 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.79 
 
 
562 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 
505 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
535 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
619 aa  124  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
533 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.17 
 
 
529 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
512 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
535 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 
522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 
596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.35 
 
 
527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
537 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>