More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 671 aa  1365    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  41.31 
 
 		 651 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  37.65 
 
 		 645 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  37.04 
 
 		 645 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 642 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.5 
 
 		 638 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  36.39 
 
 		 641 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 		 655 aa  334  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 		 664 aa  330  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  32.7 
 
 		 640 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  32.15 
 
 		 638 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 655 aa  281  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 657 aa  278  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 658 aa  270  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 657 aa  270  7e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 658 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 643 aa  243  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  30.49 
 
 		 686 aa  239  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.84 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 682 aa  233  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 633 aa  226  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 		 645 aa  225  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 635 aa  224  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 639 aa  223  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  28.64 
 
 		 635 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.02 
 
 		 626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  31.2 
 
 		 664 aa  208  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.03 
 
 		 679 aa  204  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 659 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 656 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 655 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 765 aa  183  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 735 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 729 aa  177  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 757 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 735 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 580 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 		 578 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 727 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 728 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 		 589 aa  124  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 		 696 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 607 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 		 695 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 589 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 693 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 581 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 587 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 591 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 579 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 579 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 578 aa  109  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 595 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  24.22 
 
 		 584 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 594 aa  98.2  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 587 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 536 aa  97.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  27.09 
 
 		 695 aa  95.1  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 548 aa  94.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 548 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 508 aa  92  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.95 
 
 		 531 aa  92.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 565 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.38 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 		 631 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 638 aa  88.6  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.76 
 
 		 587 aa  87.4  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 554 aa  87.4  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.3 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 559 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.76 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 576 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  22.72 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.99 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 544 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  22.54 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.24 
 
 		 542 aa  79.7  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.3 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 524 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.88 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  20.12 
 
 		 537 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 553 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.34 
 
 		 520 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>