More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3373 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  63.4 
 
 
642 aa  878    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
641 aa  1327    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  40.78 
 
 
651 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  38.56 
 
 
638 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  35.52 
 
 
645 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.39 
 
 
671 aa  402  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  35.21 
 
 
645 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 
655 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 
664 aa  317  4e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
655 aa  312  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  30.9 
 
 
640 aa  306  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 
658 aa  289  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
658 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  30.62 
 
 
638 aa  286  7e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.63 
 
 
633 aa  277  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 
643 aa  276  8e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
657 aa  275  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
657 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 
645 aa  246  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
682 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  29.68 
 
 
686 aa  233  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 
765 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 
635 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 
664 aa  212  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 
735 aa  211  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
635 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
656 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  32.5 
 
 
679 aa  203  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 
729 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 
659 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
757 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
639 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
735 aa  194  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
633 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.41 
 
 
626 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
728 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
655 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 
580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
578 aa  130  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
578 aa  120  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
693 aa  120  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
594 aa  118  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 
584 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  22.78 
 
 
607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 
696 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 
591 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
595 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 
573 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 
695 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  22.57 
 
 
607 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
638 aa  108  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
584 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  24.53 
 
 
695 aa  107  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.07 
 
 
578 aa  107  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
587 aa  103  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
577 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.46 
 
 
587 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
551 aa  98.6  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
579 aa  97.1  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
579 aa  96.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 
593 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 
577 aa  94.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 
581 aa  94  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.29 
 
 
540 aa  93.6  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.28 
 
 
586 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
565 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
539 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.55 
 
 
537 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
544 aa  86.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  22.66 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
537 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23 
 
 
532 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  23.89 
 
 
495 aa  82.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  22.47 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 
507 aa  80.5  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
544 aa  80.5  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 
533 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
538 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  22.12 
 
 
557 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  22.57 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 
559 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.52 
 
 
532 aa  78.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
586 aa  78.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.6 
 
 
539 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  22.79 
 
 
537 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.62 
 
 
538 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  21.66 
 
 
545 aa  77.4  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  22.64 
 
 
560 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.82 
 
 
542 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>