More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2424 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  49.55 
 
 		 765 aa  741    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 728 aa  1499    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  48.15 
 
 		 735 aa  711    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  56.91 
 
 		 656 aa  762    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  92.72 
 
 		 727 aa  1343    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  56.35 
 
 		 659 aa  760    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  48.39 
 
 		 729 aa  693    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  61.08 
 
 		 735 aa  889    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  60.93 
 
 		 757 aa  873    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 638 aa  293  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  31.38 
 
 		 640 aa  281  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 664 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 655 aa  256  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 655 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 682 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 643 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 658 aa  232  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 658 aa  231  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  33.6 
 
 		 645 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 657 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  33.13 
 
 		 645 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 		 657 aa  210  9e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 639 aa  205  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.39 
 
 		 638 aa  204  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.74 
 
 		 633 aa  204  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 651 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 633 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 642 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 635 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 		 641 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 635 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 643 aa  161  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 645 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.09 
 
 		 679 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 664 aa  158  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 		 686 aa  156  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.51 
 
 		 626 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 655 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 589 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 671 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 587 aa  125  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 584 aa  121  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 		 573 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  28.29 
 
 		 695 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 693 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.77 
 
 		 587 aa  114  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 696 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 		 695 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 578 aa  109  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 		 580 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.07 
 
 		 520 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 		 645 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 578 aa  108  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.89 
 
 		 538 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.82 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.11 
 
 		 588 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 595 aa  104  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.64 
 
 		 532 aa  104  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.07 
 
 		 527 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 564 aa  102  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 587 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.5 
 
 		 534 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 544 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  23.11 
 
 		 584 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 544 aa  99  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.36 
 
 		 524 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 		 607 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.64 
 
 		 534 aa  97.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 591 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 538 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 536 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 577 aa  95.1  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.65 
 
 		 539 aa  94.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 533 aa  94.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 607 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 579 aa  93.6  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 		 534 aa  92.8  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 579 aa  92.8  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 629 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.39 
 
 		 495 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 533 aa  92.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 594 aa  92  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 544 aa  92  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 		 627 aa  91.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 597 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 		 631 aa  90.1  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 544 aa  90.5  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 577 aa  89.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 536 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 537 aa  89.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.86 
 
 		 546 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 533 aa  87.4  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 526 aa  86.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.92 
 
 		 531 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 604 aa  86.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 528 aa  86.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.61 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>