More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1687 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  55.07 
 
 		 655 aa  674    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  62.92 
 
 		 655 aa  808    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 664 aa  1359    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  50.23 
 
 		 643 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  48.49 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  46.97 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 		 658 aa  489  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 		 658 aa  490  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 		 657 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  41.65 
 
 		 657 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  40.91 
 
 		 633 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  35.77 
 
 		 651 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  35.01 
 
 		 645 aa  362  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  35.17 
 
 		 645 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  35.09 
 
 		 686 aa  349  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.72 
 
 		 638 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.44 
 
 		 671 aa  330  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 633 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 		 641 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  33.68 
 
 		 664 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  34.6 
 
 		 735 aa  313  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  33.72 
 
 		 635 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  33.22 
 
 		 635 aa  308  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 642 aa  303  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.39 
 
 		 626 aa  301  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  34.06 
 
 		 765 aa  300  5e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  33.1 
 
 		 643 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  33.23 
 
 		 659 aa  291  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  32.04 
 
 		 729 aa  286  9e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 639 aa  280  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  32.81 
 
 		 656 aa  277  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 		 645 aa  266  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 728 aa  266  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 727 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 655 aa  260  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 757 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 735 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.84 
 
 		 679 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 589 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  26.72 
 
 		 695 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 693 aa  157  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 695 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 580 aa  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 589 aa  151  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 		 696 aa  150  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 595 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 		 584 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 594 aa  140  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 		 578 aa  138  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 607 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 584 aa  132  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 607 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 579 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 578 aa  120  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.72 
 
 		 545 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 544 aa  117  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 627 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 577 aa  110  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 		 577 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 578 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 557 aa  103  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 544 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  25.66 
 
 		 587 aa  101  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 538 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 581 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 551 aa  97.4  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 544 aa  97.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.58 
 
 		 538 aa  97.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 533 aa  95.5  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 508 aa  94.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 540 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 531 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.48 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 544 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.38 
 
 		 540 aa  91.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 565 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  23.79 
 
 		 540 aa  90.5  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.19 
 
 		 532 aa  90.1  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 534 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.61 
 
 		 546 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 597 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 537 aa  89  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 576 aa  87.4  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.12 
 
 		 516 aa  87  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 551 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  22.27 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  21.17 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>