More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0500 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  57.7 
 
 		 655 aa  751    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  57.28 
 
 		 655 aa  723    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 643 aa  1305    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  50.86 
 
 		 664 aa  601  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  45.26 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  43.35 
 
 		 638 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  40.39 
 
 		 658 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  40.39 
 
 		 658 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  40.63 
 
 		 657 aa  462  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  40.72 
 
 		 657 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.39 
 
 		 633 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 682 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  33.17 
 
 		 651 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  33.81 
 
 		 686 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  32.59 
 
 		 645 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  32.27 
 
 		 645 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.62 
 
 		 638 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 642 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 		 765 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  31.59 
 
 		 641 aa  276  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 735 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  32.78 
 
 		 656 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 		 729 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 633 aa  264  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 635 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 		 635 aa  262  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.15 
 
 		 626 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 		 659 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  30.28 
 
 		 664 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 757 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.22 
 
 		 671 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 735 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 643 aa  239  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 639 aa  236  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 727 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 728 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 655 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.13 
 
 		 679 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 645 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 693 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  27.23 
 
 		 695 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 		 696 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 695 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 584 aa  134  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 573 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 591 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 584 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 589 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 589 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 595 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 578 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 607 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 594 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  23.88 
 
 		 587 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 587 aa  123  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 607 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 581 aa  110  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.35 
 
 		 587 aa  110  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 578 aa  107  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 638 aa  99.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.42 
 
 		 627 aa  98.6  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.89 
 
 		 588 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 577 aa  95.9  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 		 554 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 579 aa  90.9  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0332  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 580 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  22.49 
 
 		 544 aa  89.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 581 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 580 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 578 aa  88.2  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 538 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.12 
 
 		 538 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.57 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 526 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  22.73 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 557 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.47 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.78 
 
 		 587 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  21.62 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.81 
 
 		 592 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.91 
 
 		 546 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  21.43 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.11 
 
 		 593 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.11 
 
 		 593 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.11 
 
 		 593 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.23 
 
 		 525 aa  76.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  20.41 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>