More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2808 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 727 aa  1496    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  49 
 
 		 735 aa  709    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  56.5 
 
 		 659 aa  761    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  48.73 
 
 		 729 aa  695    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  60.95 
 
 		 735 aa  892    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  49.29 
 
 		 765 aa  743    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  92.45 
 
 		 728 aa  1333    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  61.7 
 
 		 757 aa  881    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  56.46 
 
 		 656 aa  765    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  30.98 
 
 		 638 aa  300  8e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 		 640 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 664 aa  264  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 655 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 655 aa  252  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 682 aa  237  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 643 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 658 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 		 645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  32.92 
 
 		 645 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 657 aa  212  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 633 aa  207  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.83 
 
 		 638 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.5 
 
 		 633 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 657 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 639 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  28.62 
 
 		 651 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 642 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 		 635 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 635 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 641 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.32 
 
 		 679 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 643 aa  158  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 664 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.03 
 
 		 626 aa  154  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 		 686 aa  154  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 655 aa  151  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 589 aa  141  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 587 aa  127  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.38 
 
 		 671 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 573 aa  124  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  28.23 
 
 		 695 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 584 aa  120  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 693 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 696 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 695 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 578 aa  115  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.7 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 578 aa  110  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  23.56 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.4 
 
 		 520 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.7 
 
 		 538 aa  104  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.64 
 
 		 588 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.36 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.84 
 
 		 534 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.54 
 
 		 542 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.4 
 
 		 527 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 595 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.99 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 544 aa  99.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 		 584 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 544 aa  98.6  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 		 587 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  23.66 
 
 		 645 aa  98.6  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.65 
 
 		 524 aa  98.2  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 591 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 607 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 579 aa  94.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 533 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 579 aa  94.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.93 
 
 		 607 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 577 aa  94  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 536 aa  94  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 538 aa  92.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 534 aa  92.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 629 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 577 aa  91.3  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 544 aa  90.5  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.38 
 
 		 539 aa  90.5  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 536 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 544 aa  90.1  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 594 aa  89.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 597 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  25.07 
 
 		 533 aa  89.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 537 aa  89  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  25.72 
 
 		 495 aa  88.2  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.8 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 		 627 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 		 631 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.63 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.77 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 578 aa  84.3  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>