More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1356 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  87.25 
 
 		 596 aa  1102    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6956  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  64.16 
 
 		 571 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  68.29 
 
 		 597 aa  834    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  73.32 
 
 		 596 aa  914    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 596 aa  1233    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  50.28 
 
 		 580 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  50.28 
 
 		 580 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  48.69 
 
 		 588 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  47.24 
 
 		 581 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0383  extracellular solute-binding protein  45.4 
 
 		 618 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.531894  normal  0.778896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 		 621 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  43.68 
 
 		 615 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  41.45 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3874  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  41.08 
 
 		 585 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2770  extracellular solute-binding protein  41.93 
 
 		 603 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.14158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 		 566 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3294  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0715  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 		 565 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.84 
 
 		 556 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  29.2 
 
 		 534 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.55 
 
 		 542 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.68 
 
 		 546 aa  144  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 539 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 544 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.07 
 
 		 540 aa  140  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.81 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 535 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.95 
 
 		 532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.44 
 
 		 560 aa  134  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 		 509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 538 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 559 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 604 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.39 
 
 		 532 aa  127  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.54 
 
 		 520 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 565 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25 
 
 		 538 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.67 
 
 		 594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  24.39 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 528 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.25 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 617 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.68 
 
 		 534 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 544 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.58 
 
 		 557 aa  120  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.28 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 534 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1420  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.87 
 
 		 560 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 534 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 		 522 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 547 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.4 
 
 		 539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  25.95 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.32 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.06 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  23.63 
 
 		 566 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 639 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 544 aa  115  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  29.18 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  29.8 
 
 		 538 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 530 aa  114  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 528 aa  114  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.44 
 
 		 567 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  27.3 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 567 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.7 
 
 		 576 aa  112  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.11 
 
 		 529 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 538 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 545 aa  111  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.47 
 
 		 527 aa  111  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 		 593 aa  110  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 509 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.35 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 539 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 579 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  26.75 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>