More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0383 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0383  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 618 aa  1258    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.531894  normal  0.778896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  89.73 
 
 		 621 aa  1080    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2770  extracellular solute-binding protein  74.75 
 
 		 603 aa  917    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.14158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  85.53 
 
 		 615 aa  980    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  48.19 
 
 		 568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  48.26 
 
 		 588 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  47.39 
 
 		 581 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  47.6 
 
 		 580 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  47.6 
 
 		 580 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  46.08 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3874  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  45.23 
 
 		 585 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3294  extracellular solute-binding protein  45.49 
 
 		 573 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0715  extracellular solute-binding protein  43.25 
 
 		 565 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  44.88 
 
 		 596 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 		 596 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6956  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  41.59 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  42.73 
 
 		 597 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  43.72 
 
 		 596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.09 
 
 		 556 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.49 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 545 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 552 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  28.08 
 
 		 560 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.69 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.69 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.69 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.73 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.69 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 544 aa  117  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 564 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 528 aa  114  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.33 
 
 		 525 aa  113  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 524 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.86 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 536 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  24.86 
 
 		 509 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.28 
 
 		 539 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.99 
 
 		 542 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 565 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 526 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 509 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 586 aa  110  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 508 aa  110  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.9 
 
 		 515 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 		 525 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 534 aa  110  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 552 aa  109  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.33 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 544 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.21 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 533 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  22.81 
 
 		 532 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 544 aa  105  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.37 
 
 		 525 aa  104  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.3 
 
 		 546 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0655  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 540 aa  104  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1277  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 598 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.72 
 
 		 605 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.24 
 
 		 534 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 535 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 		 532 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 541 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 547 aa  103  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.37 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 516 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.89 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.36 
 
 		 532 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.29 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  24.67 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 549 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1361  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  25.87 
 
 		 544 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0151112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 567 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.06 
 
 		 529 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 505 aa  101  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 544 aa  101  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1439  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 540 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>