More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5343 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  65.14 
 
 
532 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  64.54 
 
 
532 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
535 aa  1060    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  82.67 
 
 
528 aa  879    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  62.55 
 
 
528 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  63.74 
 
 
532 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  48.08 
 
 
533 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  47.42 
 
 
552 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  48 
 
 
529 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  46.83 
 
 
528 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  48 
 
 
529 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  43.77 
 
 
532 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  49 
 
 
529 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  41.86 
 
 
532 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  45.73 
 
 
525 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  45.91 
 
 
525 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  45.73 
 
 
525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 
525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  42.69 
 
 
525 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  42.69 
 
 
525 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 
526 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  41.08 
 
 
545 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  37.45 
 
 
526 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  37.67 
 
 
526 aa  364  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 
549 aa  359  7e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
544 aa  355  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  35.37 
 
 
558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  34.57 
 
 
543 aa  321  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.57 
 
 
543 aa  321  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.57 
 
 
543 aa  321  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  34.57 
 
 
543 aa  321  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.57 
 
 
558 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  34.57 
 
 
558 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 
545 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.57 
 
 
558 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.57 
 
 
558 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
561 aa  319  6e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 
533 aa  319  7e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  34.46 
 
 
555 aa  316  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.38 
 
 
543 aa  316  8e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  34.49 
 
 
554 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.18 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  34.31 
 
 
525 aa  313  6.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 
544 aa  311  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.5 
 
 
543 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.34 
 
 
543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 
536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.34 
 
 
543 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.34 
 
 
543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.34 
 
 
543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.34 
 
 
543 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 
545 aa  306  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  34.81 
 
 
560 aa  306  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  33.21 
 
 
538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  33.21 
 
 
538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 
538 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  34.81 
 
 
538 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  33.53 
 
 
535 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  33.53 
 
 
559 aa  296  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  33 
 
 
537 aa  296  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  33.59 
 
 
547 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  33 
 
 
537 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  33.79 
 
 
541 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  33.47 
 
 
537 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 
542 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
538 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  33 
 
 
537 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  33 
 
 
537 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  33 
 
 
537 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
537 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  33 
 
 
537 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  33 
 
 
537 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 
539 aa  295  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  33 
 
 
537 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 
547 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  33.13 
 
 
538 aa  289  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 
543 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  32.6 
 
 
537 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  32.67 
 
 
556 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  35 
 
 
537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  32.6 
 
 
537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  32.39 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  34.79 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  32.19 
 
 
537 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  32.19 
 
 
537 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 
538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 
544 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 
556 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 
549 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  34.79 
 
 
537 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  34.79 
 
 
537 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  34.79 
 
 
537 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  32.47 
 
 
545 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  34.41 
 
 
535 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  32.22 
 
 
544 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
543 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 
534 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>