More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5725 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 519 aa  1028    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  43.73 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  40.85 
 
 		 518 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04010  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  40.32 
 
 		 548 aa  309  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115797  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4500  extracellular solute-binding protein family 5  38.77 
 
 		 528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0119  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 		 532 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1971  extracellular solute-binding protein family 5  38.05 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.743088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  26.48 
 
 		 510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.65 
 
 		 511 aa  192  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  32 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1071  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  31 
 
 		 525 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0509495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1125  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 525 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0107082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3547  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  31 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000727174  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.95 
 
 		 511 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 533 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  31.86 
 
 		 533 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1465  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1925  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.92 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.96 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1345  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  30.12 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3644  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1361  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  29.92 
 
 		 544 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0151112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 539 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1376  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  30.12 
 
 		 544 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.268389 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.7 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  32.14 
 
 		 534 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1345  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.77 
 
 		 552 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.932628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 508 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0035  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 		 546 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000195087  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2106  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  29.72 
 
 		 544 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.92 
 
 		 538 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0187  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.8 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  27.39 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.56 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1329  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  33.26 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.1 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1675  oligopeptide-binding protein OppA  28.6 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0331  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 542 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  28.88 
 
 		 540 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 576 aa  160  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 540 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 557 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 534 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.79 
 
 		 556 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  32.72 
 
 		 531 aa  156  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  31.05 
 
 		 524 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  30.72 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.72 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.52 
 
 		 523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.09 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 565 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.61 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 517 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 579 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 559 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.38 
 
 		 524 aa  144  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.38 
 
 		 524 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.52 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.52 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.52 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.38 
 
 		 524 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.38 
 
 		 524 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2550  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 523 aa  143  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00133049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 		 563 aa  143  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0216  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 569 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.44 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.38 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.32 
 
 		 521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.16 
 
 		 524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  29.16 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  29.16 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.72 
 
 		 520 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.04 
 
 		 545 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 534 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 555 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.55 
 
 		 538 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 		 533 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 551 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 514 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.91 
 
 		 528 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.91 
 
 		 528 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 		 502 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.7 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.7 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.7 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>