More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2321 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
580 aa  1195    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  67.56 
 
 
588 aa  804    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
580 aa  1195    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  69.54 
 
 
581 aa  850    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  50.19 
 
 
596 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  50.28 
 
 
596 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  49.72 
 
 
621 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  50.09 
 
 
597 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6956  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  46.9 
 
 
571 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  46.57 
 
 
615 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0383  extracellular solute-binding protein  48.25 
 
 
618 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.531894  normal  0.778896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  47.87 
 
 
596 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2770  extracellular solute-binding protein  43.33 
 
 
603 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.14158  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  43.95 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3874  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  43.9 
 
 
585 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  43.66 
 
 
566 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3294  extracellular solute-binding protein  41.23 
 
 
573 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0715  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 
565 aa  435  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109389  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.03 
 
 
556 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
587 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.54 
 
 
540 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
544 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
617 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.36 
 
 
524 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.85 
 
 
539 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
559 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  27.78 
 
 
579 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.78 
 
 
580 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
639 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.15 
 
 
546 aa  150  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.06 
 
 
542 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.76 
 
 
532 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
576 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
591 aa  144  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
533 aa  144  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.7 
 
 
532 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  27.47 
 
 
605 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
508 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  26.84 
 
 
566 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.1 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.65 
 
 
567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.56 
 
 
592 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
567 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 
607 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
540 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 
607 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 
631 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.07 
 
 
538 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.82 
 
 
515 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.96 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.96 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 
533 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.96 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.72 
 
 
589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 
531 aa  135  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
565 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
605 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.05 
 
 
524 aa  133  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
591 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.96 
 
 
626 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 
536 aa  133  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
555 aa  133  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
604 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.61 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
530 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.99 
 
 
560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 
511 aa  130  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 
563 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 
586 aa  130  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 
509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 
600 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.19 
 
 
534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
544 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 
557 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.2 
 
 
534 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 
528 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
578 aa  128  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.91 
 
 
531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.09 
 
 
516 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 
580 aa  127  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 
535 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
529 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.8 
 
 
593 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  26.31 
 
 
628 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.8 
 
 
593 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.8 
 
 
593 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 
534 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.8 
 
 
593 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
516 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
534 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.01 
 
 
562 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.96 
 
 
511 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>