More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4796 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  69.55 
 
 		 527 aa  765    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 532 aa  1082    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  69.55 
 
 		 527 aa  765    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  94.17 
 
 		 532 aa  1013    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.85 
 
 		 546 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.67 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2945  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472455  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.11 
 
 		 508 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 538 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.49 
 
 		 538 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 534 aa  170  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.46 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.66 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.97 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.66 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.54 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.54 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.54 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.73 
 
 		 510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.34 
 
 		 528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.54 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.82 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 532 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.54 
 
 		 515 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.65 
 
 		 524 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.21 
 
 		 588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 		 508 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.49 
 
 		 510 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 533 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 		 534 aa  153  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29 
 
 		 520 aa  153  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.65 
 
 		 532 aa  153  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.75 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 534 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.68 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 		 544 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.39 
 
 		 520 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.19 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.31 
 
 		 534 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 514 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 524 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  30.6 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.04 
 
 		 524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 557 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 		 529 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.05 
 
 		 539 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.03 
 
 		 532 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  31.52 
 
 		 538 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.95 
 
 		 511 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 538 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.26 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 579 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  31.14 
 
 		 527 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.32 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.46 
 
 		 556 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 539 aa  144  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.65 
 
 		 534 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 517 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.86 
 
 		 517 aa  143  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 516 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 576 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.42 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.53 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  28.97 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 531 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 551 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  28.66 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 565 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 591 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>