More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2749 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 645 aa  1325    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 608 aa  183  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  27.52 
 
 		 577 aa  177  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  28.15 
 
 		 627 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 597 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 579 aa  164  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 636 aa  160  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 625 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  26.66 
 
 		 625 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  27.26 
 
 		 557 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 619 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 630 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 626 aa  142  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 559 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 567 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 625 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 547 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 611 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 557 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 		 620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 557 aa  135  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 634 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 634 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 654 aa  131  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 568 aa  130  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.68 
 
 		 564 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 576 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.1 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  23.93 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 544 aa  125  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 604 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  25.27 
 
 		 572 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.07 
 
 		 514 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.27 
 
 		 515 aa  120  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 604 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.37 
 
 		 551 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 510 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.28 
 
 		 562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 544 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.76 
 
 		 534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 551 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.83 
 
 		 563 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.47 
 
 		 545 aa  112  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.83 
 
 		 525 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 559 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 587 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.43 
 
 		 534 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 609 aa  110  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 536 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.38 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 		 636 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 567 aa  109  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  27.59 
 
 		 495 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 562 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25.11 
 
 		 510 aa  106  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 633 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.97 
 
 		 524 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  24.17 
 
 		 560 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.82 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  24.22 
 
 		 561 aa  104  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 540 aa  103  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.27 
 
 		 525 aa  103  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.65 
 
 		 556 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.71 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  25.46 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 631 aa  101  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.82 
 
 		 527 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.09 
 
 		 575 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.89 
 
 		 567 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.31 
 
 		 516 aa  100  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  23.69 
 
 		 560 aa  100  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 659 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.05 
 
 		 605 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.87 
 
 		 546 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.07 
 
 		 540 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 565 aa  100  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 575 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 557 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.81 
 
 		 575 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 567 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 512 aa  99.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 596 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.93 
 
 		 532 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 539 aa  98.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.81 
 
 		 575 aa  98.2  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>