More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1115 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1115  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 596 aa  1213    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  63.87 
 
 		 592 aa  781    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  42.18 
 
 		 593 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  41.93 
 
 		 591 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.37 
 
 		 593 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.37 
 
 		 593 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  38.66 
 
 		 592 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.3 
 
 		 593 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.33 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.33 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.33 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  39.4 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0778  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  35.26 
 
 		 605 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000335108  hitchhiker  0.00000000000176984 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  33.1 
 
 		 590 aa  304  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1615  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  34.11 
 
 		 596 aa  301  3e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176956  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2026  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  35.56 
 
 		 600 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00409621  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D17  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  33.85 
 
 		 600 aa  277  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1666  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  34.62 
 
 		 467 aa  277  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0728  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  30.65 
 
 		 591 aa  250  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.414053 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 571 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 571 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 557 aa  181  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 		 574 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  26.57 
 
 		 579 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 573 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.79 
 
 		 580 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 572 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.67 
 
 		 575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  29.42 
 
 		 559 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.78 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  29.56 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  28.57 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.56 
 
 		 575 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 575 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  28.57 
 
 		 575 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  29.33 
 
 		 575 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 575 aa  124  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.56 
 
 		 567 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 567 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.56 
 
 		 566 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25 
 
 		 540 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  32.4 
 
 		 538 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 579 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 595 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 524 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 551 aa  100  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.76 
 
 		 545 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 		 584 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 587 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 539 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 607 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 607 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  23.93 
 
 		 581 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.66 
 
 		 589 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 588 aa  94  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 513 aa  93.6  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  23.72 
 
 		 510 aa  93.2  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 617 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 519 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 503 aa  91.7  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 		 580 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 544 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 		 580 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 595 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 559 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 587 aa  90.9  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 533 aa  90.9  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 		 517 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 513 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.11 
 
 		 588 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 576 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.08 
 
 		 511 aa  88.6  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 604 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 518 aa  88.6  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 531 aa  87.4  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 537 aa  87.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5167  4-phytase  24.24 
 
 		 530 aa  87  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  0.719428 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 		 491 aa  87  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 594 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 579 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.06 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 565 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.82 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 579 aa  84.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.78 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.48 
 
 		 562 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 534 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 639 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 544 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>