More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3496 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
590 aa  1198    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  42.29 
 
 
604 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  42.16 
 
 
605 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  40.37 
 
 
587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
639 aa  211  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
617 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.8 
 
 
540 aa  157  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
540 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.67 
 
 
538 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 
576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
588 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
551 aa  143  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.78 
 
 
546 aa  142  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
534 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
538 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
565 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
533 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
592 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
591 aa  133  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  21.12 
 
 
593 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.82 
 
 
593 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2361  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  29.31 
 
 
445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0243915 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 
591 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.41 
 
 
593 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 
622 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
559 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.83 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.83 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.83 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 
581 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.78 
 
 
593 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  23 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
541 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1058  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  31.15 
 
 
653 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.45 
 
 
511 aa  117  6e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3074  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 
621 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000149398  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0413  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  30.77 
 
 
653 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2277  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 
615 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00527261  decreased coverage  0.000000000210766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.73 
 
 
580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  24.73 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
544 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 
526 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
563 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
508 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.17 
 
 
524 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.34 
 
 
557 aa  108  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.11 
 
 
516 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.84 
 
 
556 aa  107  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
555 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
544 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.66 
 
 
534 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.89 
 
 
534 aa  104  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 
545 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  21.38 
 
 
579 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
536 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  21.97 
 
 
524 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
600 aa  100  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.26 
 
 
542 aa  99.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  22.06 
 
 
575 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
629 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  22.42 
 
 
510 aa  97.4  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.03 
 
 
511 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
596 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.1 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 
571 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 
571 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 
529 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
557 aa  95.5  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
557 aa  95.5  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  24.77 
 
 
529 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 
562 aa  94.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.86 
 
 
511 aa  94  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  22.66 
 
 
520 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  21.14 
 
 
573 aa  93.2  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
608 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 
593 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
528 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
575 aa  92.8  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.41 
 
 
511 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 
567 aa  92  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.22 
 
 
575 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  26.06 
 
 
549 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.8 
 
 
524 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
545 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  22.95 
 
 
575 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.57 
 
 
567 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.68 
 
 
594 aa  90.1  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  22.74 
 
 
577 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
549 aa  89.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  22.27 
 
 
580 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 
628 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 
527 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.11 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 
548 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.74 
 
 
555 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.74 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>