More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1403 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 866 aa  1781    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 559 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.26 
 
 		 538 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 538 aa  208  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 540 aa  207  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.21 
 
 		 546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 576 aa  196  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 539 aa  187  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 		 563 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.02 
 
 		 540 aa  180  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 551 aa  177  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 533 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 534 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 618 aa  157  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 619 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_002620  TC0765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.87 
 
 		 696 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.345904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 622 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.72 
 
 		 562 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 545 aa  137  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 600 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 628 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 		 501 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 608 aa  124  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 593 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.45 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 553 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 		 561 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5439  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 593 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  25.37 
 
 		 566 aa  121  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.37 
 
 		 567 aa  121  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.7 
 
 		 596 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.57 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.27 
 
 		 580 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  24.27 
 
 		 579 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 528 aa  119  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.7 
 
 		 516 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 508 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 567 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 517 aa  114  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1420  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.03 
 
 		 560 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 544 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1789  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 572 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.95 
 
 		 524 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 528 aa  112  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0940  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 		 559 aa  111  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.72 
 
 		 541 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.14 
 
 		 594 aa  109  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 531 aa  109  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.67 
 
 		 545 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 		 565 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 519 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 613 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.09 
 
 		 542 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 524 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 		 509 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.56 
 
 		 556 aa  106  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.57 
 
 		 524 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 602 aa  105  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  25.2 
 
 		 602 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  25.34 
 
 		 615 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1532  extracellular solute-binding protein family 5  21.86 
 
 		 559 aa  105  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0243395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0982  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 		 567 aa  105  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 532 aa  105  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 509 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.29 
 
 		 531 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  21 
 
 		 527 aa  105  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.58 
 
 		 509 aa  105  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 575 aa  104  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  22.29 
 
 		 575 aa  103  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 615 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3741  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 623 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2365  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 601 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0436387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 627 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  22.08 
 
 		 575 aa  101  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 615 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2453  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 601 aa  101  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000003014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 551 aa  101  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2410  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 601 aa  101  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2456  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 601 aa  101  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 517 aa  101  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 611 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.53 
 
 		 510 aa  100  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.58 
 
 		 575 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 532 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3315  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  23.71 
 
 		 604 aa  100  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.644955  normal  0.133502 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 528 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 536 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  27.27 
 
 		 532 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0781  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  23.9 
 
 		 604 aa  99.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1277  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 641 aa  99.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  23.71 
 
 		 604 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 544 aa  99.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>