More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0273 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  100 
 
 
525 aa  1073    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  66.22 
 
 
524 aa  700    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  56.9 
 
 
530 aa  619  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0020  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  45.86 
 
 
539 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  47 
 
 
526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  45.35 
 
 
526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  45.35 
 
 
526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  45.27 
 
 
538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  43.26 
 
 
532 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  43.79 
 
 
524 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  43.79 
 
 
524 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  43.79 
 
 
524 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  43.59 
 
 
524 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  43.79 
 
 
524 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  43.79 
 
 
524 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  43.79 
 
 
524 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2277  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding  45.95 
 
 
553 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0883096  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  43.59 
 
 
524 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  43.59 
 
 
524 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  44.33 
 
 
524 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  44.76 
 
 
523 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2372  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  38.72 
 
 
532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  37.9 
 
 
532 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  37.9 
 
 
532 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  44.83 
 
 
488 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3342  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  45.04 
 
 
524 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  39.72 
 
 
513 aa  372  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  39.96 
 
 
544 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  34.99 
 
 
538 aa  317  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  30 
 
 
538 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  30.91 
 
 
537 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 
544 aa  196  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 
547 aa  196  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 
549 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
526 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  28.72 
 
 
511 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  31.32 
 
 
535 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.7 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  28.68 
 
 
540 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
539 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  27.43 
 
 
562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
544 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 
542 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 
533 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 
537 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.71 
 
 
511 aa  157  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 
541 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
538 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
512 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.93 
 
 
538 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.87 
 
 
510 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
522 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 
537 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 
534 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.76 
 
 
546 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 
534 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.27 
 
 
511 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.66 
 
 
575 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 
515 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.66 
 
 
575 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 
551 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.78 
 
 
511 aa  150  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  29.37 
 
 
560 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
544 aa  149  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
536 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
551 aa  147  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 
519 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.57 
 
 
520 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 
575 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
555 aa  146  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 
575 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.01 
 
 
511 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
540 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 
575 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  30.25 
 
 
510 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.11 
 
 
575 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.71 
 
 
511 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.74 
 
 
526 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
516 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.53 
 
 
509 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.95 
 
 
521 aa  143  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  32.35 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.95 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
544 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.95 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  30.88 
 
 
532 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.91 
 
 
555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.91 
 
 
575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.97 
 
 
535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.86 
 
 
531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.04 
 
 
520 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
515 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
501 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.12 
 
 
550 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
512 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>