More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1676 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 636 aa  1277    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  45.39 
 
 		 559 aa  510  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  46.89 
 
 		 557 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  46.89 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  45.17 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  43.4 
 
 		 580 aa  422  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  40.04 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  37.39 
 
 		 587 aa  357  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 604 aa  282  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 604 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 576 aa  256  9e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  31.44 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  31.11 
 
 		 548 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 551 aa  194  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.85 
 
 		 545 aa  193  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  28.68 
 
 		 567 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 		 568 aa  191  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  28.31 
 
 		 560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 		 627 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  28.07 
 
 		 560 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 		 547 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  27.96 
 
 		 577 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.55 
 
 		 609 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.22 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 557 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 579 aa  166  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 579 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.12 
 
 		 551 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 645 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 597 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 562 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 		 554 aa  153  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 565 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 625 aa  145  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 625 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.68 
 
 		 552 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 620 aa  140  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 626 aa  137  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.71 
 
 		 563 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 565 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.38 
 
 		 564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 619 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 659 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 561 aa  124  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 625 aa  124  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 633 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 611 aa  118  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 1437 aa  118  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 510 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 529 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 634 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.4 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 544 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.56 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 593 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.67 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.14 
 
 		 563 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 522 aa  108  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 634 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 549 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 527 aa  107  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 511 aa  107  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 636 aa  107  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.8 
 
 		 565 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 654 aa  107  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.48 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 568 aa  106  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 510 aa  104  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 536 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 584 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 629 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5439  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 593 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.16 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.16 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  24.77 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>