More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2053 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 579 aa  1184    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  76.39 
 
 		 577 aa  920    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  34.03 
 
 		 608 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 659 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 625 aa  195  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 625 aa  193  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 630 aa  187  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 626 aa  177  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 619 aa  171  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 634 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 		 633 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 654 aa  168  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 636 aa  166  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 611 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 645 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 597 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  23.88 
 
 		 620 aa  153  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 		 634 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  29.11 
 
 		 572 aa  150  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 587 aa  150  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  28.08 
 
 		 568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 560 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.76 
 
 		 545 aa  147  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 547 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 551 aa  137  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 579 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 567 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 562 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 627 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 561 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 557 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 557 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 559 aa  124  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.63 
 
 		 556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 633 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 567 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 		 576 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.15 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 		 580 aa  114  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  26.04 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  26.04 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.68 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.04 
 
 		 552 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.5 
 
 		 563 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.14 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.14 
 
 		 609 aa  104  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.39 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 522 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  22.12 
 
 		 554 aa  100  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.59 
 
 		 551 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 554 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  26.26 
 
 		 518 aa  96.3  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25.83 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.35 
 
 		 572 aa  95.9  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 604 aa  94.7  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 532 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 532 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 604 aa  94  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 540 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  25.62 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.62 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 584 aa  93.6  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 544 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 		 549 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 		 569 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 512 aa  92.8  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 517 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 576 aa  91.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 535 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  24.15 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  39.87 
 
 		 636 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 509 aa  91.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.41 
 
 		 525 aa  90.9  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 522 aa  90.9  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 534 aa  90.9  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  23.88 
 
 		 513 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.97 
 
 		 516 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 513 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.51 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.44 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  24.82 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.65 
 
 		 511 aa  88.6  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>