More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0403 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
565 aa  1159    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  62.32 
 
 
569 aa  706    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  59.04 
 
 
554 aa  630  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
627 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 
531 aa  279  9e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  33.79 
 
 
540 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 
548 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 
548 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
597 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  30.98 
 
 
557 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 
547 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
559 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  29.21 
 
 
545 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 
567 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
551 aa  231  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 
568 aa  231  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.55 
 
 
551 aa  229  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 
557 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 
579 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  29.28 
 
 
562 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  30.98 
 
 
560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.22 
 
 
552 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  30.86 
 
 
560 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 
567 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 
576 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  30.4 
 
 
609 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  30.61 
 
 
560 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 
553 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
565 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.99 
 
 
563 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.76 
 
 
564 aa  193  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.4 
 
 
556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 
561 aa  190  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 
604 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
604 aa  169  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.24 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
557 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
557 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
512 aa  157  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
576 aa  154  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  27.06 
 
 
572 aa  153  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
559 aa  152  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
560 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 
587 aa  150  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.64 
 
 
609 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.29 
 
 
546 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
580 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 
608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 
534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.59 
 
 
562 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
552 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
526 aa  127  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.86 
 
 
538 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.56 
 
 
527 aa  126  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
540 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
540 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 
568 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 
557 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
538 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 
722 aa  120  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.57 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1345  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  30.43 
 
 
544 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1925  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.43 
 
 
544 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176538  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25.48 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.96 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 
581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
534 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.45 
 
 
580 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.45 
 
 
579 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 
529 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.68 
 
 
539 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 
509 aa  113  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.61 
 
 
524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.9 
 
 
528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.9 
 
 
528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.06 
 
 
528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.06 
 
 
528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 
581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.84 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1361  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  29.29 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0151112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.11 
 
 
531 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.24 
 
 
540 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1376  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  29.05 
 
 
544 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.268389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.85 
 
 
575 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  26.26 
 
 
575 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
584 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.96 
 
 
528 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.11 
 
 
528 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.85 
 
 
515 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.55 
 
 
525 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
512 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2106  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  28.98 
 
 
544 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610577 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
525 aa  109  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.64 
 
 
524 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>