More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2512 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 565 aa  1148    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  50.09 
 
 		 553 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  47.04 
 
 		 579 aa  530  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  43.89 
 
 		 547 aa  487  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  37.55 
 
 		 561 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  32.43 
 
 		 627 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 		 557 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 		 597 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  30.47 
 
 		 576 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  29.54 
 
 		 567 aa  223  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 559 aa  220  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.16 
 
 		 551 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 		 565 aa  210  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 569 aa  207  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 554 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 531 aa  200  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 567 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.05 
 
 		 552 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 562 aa  189  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 551 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 568 aa  169  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.39 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 557 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 557 aa  166  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 		 557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 548 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 548 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  27.12 
 
 		 560 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 580 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 636 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.41 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.08 
 
 		 563 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  25.83 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  27.45 
 
 		 572 aa  148  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.9 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 559 aa  137  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 		 609 aa  134  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.73 
 
 		 609 aa  127  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.82 
 
 		 564 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 604 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.65 
 
 		 572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 579 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.75 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.5 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.16 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 		 587 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 523 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.17 
 
 		 645 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  23.2 
 
 		 577 aa  106  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 605 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.48 
 
 		 614 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.9 
 
 		 527 aa  103  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 608 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.77 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 505 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 635 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  24.73 
 
 		 631 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 512 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 512 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 512 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.51 
 
 		 521 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 552 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.51 
 
 		 521 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.51 
 
 		 521 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.51 
 
 		 521 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 521 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  22.61 
 
 		 517 aa  97.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 524 aa  97.8  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 633 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 		 631 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 594 aa  94.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 527 aa  94.4  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  26.08 
 
 		 510 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 		 541 aa  94  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.95 
 
 		 542 aa  93.6  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 622 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 533 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.84 
 
 		 622 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 526 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 625 aa  92.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 531 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 540 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 659 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>