More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1724 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 625 aa  1296    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  59.3 
 
 		 625 aa  768    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  70.59 
 
 		 630 aa  924    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  61.08 
 
 		 654 aa  815    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  59.78 
 
 		 625 aa  771    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 611 aa  621  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  49.09 
 
 		 659 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  49.52 
 
 		 619 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  48.64 
 
 		 636 aa  567  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  47.25 
 
 		 633 aa  566  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  46.67 
 
 		 620 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  39.65 
 
 		 633 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  39.72 
 
 		 634 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  39.84 
 
 		 634 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 626 aa  352  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  25.2 
 
 		 577 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 645 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 636 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 608 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 557 aa  118  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 560 aa  114  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 559 aa  111  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.5 
 
 		 572 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 547 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 		 609 aa  98.2  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.13 
 
 		 609 aa  97.1  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 604 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.66 
 
 		 627 aa  94.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 604 aa  93.6  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 580 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 597 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 568 aa  90.9  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 531 aa  90.9  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.93 
 
 		 551 aa  90.9  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 551 aa  89.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 576 aa  89.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 567 aa  87  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 553 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 565 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.31 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 		 561 aa  83.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.33 
 
 		 556 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  23.44 
 
 		 629 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  30.26 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.96 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 		 554 aa  80.1  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  29.06 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  22.4 
 
 		 569 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 552 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  21.64 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  34.51 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  22.67 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.37 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.92 
 
 		 607 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  22.33 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  28.89 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.52 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 		 507 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 622 aa  72  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.96 
 
 		 611 aa  72  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  22.73 
 
 		 548 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  22.17 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.22 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 606 aa  70.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  22.51 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 		 589 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 581 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  23.47 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  26.83 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.11 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  20.11 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.74 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  22.68 
 
 		 565 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 580 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 554 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>