More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3466 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 596 aa  1206    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  50.96 
 
 		 589 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  48.08 
 
 		 629 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  44.24 
 
 		 600 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  44.1 
 
 		 631 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  42.88 
 
 		 605 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  41.2 
 
 		 626 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  32.24 
 
 		 588 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.94 
 
 		 546 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 534 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 531 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 531 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.71 
 
 		 531 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.01 
 
 		 575 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.81 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 539 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.6 
 
 		 559 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.24 
 
 		 543 aa  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.61 
 
 		 555 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 		 627 aa  153  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.8 
 
 		 538 aa  153  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 528 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 543 aa  153  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.61 
 
 		 575 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.85 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 556 aa  151  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 532 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.89 
 
 		 575 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  28.34 
 
 		 540 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 568 aa  150  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 557 aa  150  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.71 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.11 
 
 		 530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.24 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 		 1437 aa  148  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.24 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.24 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.24 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 540 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  26.79 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 559 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.24 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.24 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 509 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.36 
 
 		 542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.24 
 
 		 528 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.35 
 
 		 562 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.84 
 
 		 566 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.81 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.92 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.55 
 
 		 520 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  28.29 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 567 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.42 
 
 		 567 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.7 
 
 		 525 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 538 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0349  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.16 
 
 		 528 aa  144  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.827651  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 533 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.39 
 
 		 542 aa  143  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 538 aa  143  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.06 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.32 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.71 
 
 		 532 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 526 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.59 
 
 		 542 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.87 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.87 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.87 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 576 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.87 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.87 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.87 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.67 
 
 		 580 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  24.67 
 
 		 579 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.79 
 
 		 527 aa  140  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.87 
 
 		 535 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 575 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 575 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>