More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0910 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  100 
 
 		 572 aa  1160    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  57.73 
 
 		 580 aa  710    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  51.06 
 
 		 587 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 		 559 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  44.05 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  44.24 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  39.96 
 
 		 636 aa  398  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  48.43 
 
 		 366 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 604 aa  257  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 604 aa  256  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 576 aa  240  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  32.65 
 
 		 567 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  31.89 
 
 		 567 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.92 
 
 		 609 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 627 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 547 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 		 548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 559 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  30.44 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.96 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 551 aa  190  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.81 
 
 		 556 aa  187  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  32.87 
 
 		 561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.87 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  28.38 
 
 		 560 aa  179  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.36 
 
 		 551 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  28.76 
 
 		 560 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.82 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.47 
 
 		 564 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 608 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 568 aa  156  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 540 aa  156  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 565 aa  153  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 569 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 579 aa  150  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 579 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 557 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  29.09 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 510 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 553 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 534 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.89 
 
 		 572 aa  128  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 611 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.78 
 
 		 535 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.24 
 
 		 563 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 625 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  31.2 
 
 		 636 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 659 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 625 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 555 aa  114  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 517 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 512 aa  113  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.17 
 
 		 675 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.62 
 
 		 580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  26.62 
 
 		 579 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.4 
 
 		 542 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 630 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 633 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 542 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 631 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.36 
 
 		 538 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.51 
 
 		 545 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 595 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 533 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.89 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 495 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.45 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  23.98 
 
 		 537 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 625 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 538 aa  108  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 538 aa  107  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  23.62 
 
 		 519 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  26.59 
 
 		 546 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25 
 
 		 543 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.34 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  23.74 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  23.39 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  23.74 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 651 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 543 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>