More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0214 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  56.05 
 
 
604 aa  683    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  55.88 
 
 
604 aa  681    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
609 aa  1242    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  33.39 
 
 
576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31 
 
 
609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 
557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
557 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
559 aa  249  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 
636 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  32.85 
 
 
627 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 
560 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  30.95 
 
 
572 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 
580 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  30.4 
 
 
565 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
597 aa  200  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 
554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 
587 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
562 aa  187  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
567 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
557 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.4 
 
 
551 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
559 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 
548 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 
547 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
540 aa  172  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
531 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  29.59 
 
 
548 aa  170  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 
557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 
569 aa  164  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.55 
 
 
564 aa  164  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 
567 aa  163  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  29.83 
 
 
576 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  27.26 
 
 
560 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  27.92 
 
 
560 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 
568 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
579 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.08 
 
 
545 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 
553 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.44 
 
 
552 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.78 
 
 
556 aa  144  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
551 aa  142  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.36 
 
 
563 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.38 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.75 
 
 
563 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  30.28 
 
 
605 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 
631 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
510 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 
565 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.97 
 
 
539 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 
540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.74 
 
 
542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.62 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 
600 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
529 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.49 
 
 
520 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.27 
 
 
529 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.79 
 
 
529 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.53 
 
 
528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.59 
 
 
528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.34 
 
 
528 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 
580 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.59 
 
 
528 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.34 
 
 
528 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
366 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.98 
 
 
528 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 
645 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.45 
 
 
575 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.43 
 
 
524 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 
528 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
534 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  25.93 
 
 
518 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
524 aa  107  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.03 
 
 
562 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
634 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
575 aa  106  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 
622 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 
634 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
575 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
625 aa  104  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
625 aa  104  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
509 aa  104  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.23 
 
 
534 aa  104  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.26 
 
 
510 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.34 
 
 
588 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
629 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.62 
 
 
531 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 
575 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
512 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 
559 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.25 
 
 
575 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 
575 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 
557 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 
555 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 
575 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.49 
 
 
534 aa  101  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>