More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3400 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 567 aa  1156    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  39.46 
 
 		 540 aa  362  8e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 531 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  37.55 
 
 		 567 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.43 
 
 		 552 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  36.73 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  35.87 
 
 		 627 aa  299  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  34.46 
 
 		 548 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  33.86 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.59 
 
 		 551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  31.99 
 
 		 557 aa  281  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  32.11 
 
 		 545 aa  277  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 551 aa  273  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 559 aa  270  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  36 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 		 547 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 557 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 557 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  31.77 
 
 		 579 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 557 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 553 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.07 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  32.08 
 
 		 572 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  30.3 
 
 		 560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  30.04 
 
 		 560 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 		 576 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  33.58 
 
 		 587 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 565 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 559 aa  214  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 		 569 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 		 568 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 565 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 		 580 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.41 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.33 
 
 		 609 aa  177  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 560 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.27 
 
 		 564 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 609 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 604 aa  172  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 636 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.17 
 
 		 563 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 576 aa  146  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 540 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.61 
 
 		 562 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 579 aa  143  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.08 
 
 		 543 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  34.7 
 
 		 366 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  27.51 
 
 		 577 aa  136  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.02 
 
 		 542 aa  133  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.05 
 
 		 588 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 		 621 aa  123  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 		 567 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.27 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  30.96 
 
 		 636 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 534 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 528 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 1437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 523 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.73 
 
 		 587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 631 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 559 aa  113  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.25 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.54 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.61 
 
 		 534 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  27.75 
 
 		 541 aa  110  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.16 
 
 		 524 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 544 aa  108  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 600 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 527 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.02 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  22.5 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.81 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 608 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.44 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 589 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 		 534 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.33 
 
 		 538 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.22 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.59 
 
 		 510 aa  104  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 587 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 538 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>