More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0239 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 527 aa  1085    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  56.14 
 
 		 587 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  51.91 
 
 		 524 aa  569  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0041  hypothetical protein  42.64 
 
 		 529 aa  423  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.561625  normal  0.893455 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  37.43 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  37.31 
 
 		 542 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.24 
 
 		 543 aa  369  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 512 aa  150  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 		 537 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  28.16 
 
 		 562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.57 
 
 		 542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.09 
 
 		 545 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.28 
 
 		 588 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.15 
 
 		 540 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.88 
 
 		 517 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 552 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 627 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 		 503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.46 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 549 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.81 
 
 		 516 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.6 
 
 		 542 aa  116  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 579 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 622 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 618 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  24.8 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  25.22 
 
 		 560 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 		 557 aa  110  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  24.35 
 
 		 560 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1345  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.61 
 
 		 552 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.932628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 597 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 555 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.86 
 
 		 527 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.74 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 553 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.87 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.02 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 532 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  25.43 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.69 
 
 		 528 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  25.98 
 
 		 572 aa  104  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.69 
 
 		 528 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.12 
 
 		 626 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.5 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1699  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 611 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  22.37 
 
 		 505 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 510 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.18 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 604 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.18 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.49 
 
 		 528 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  23.34 
 
 		 553 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  23.01 
 
 		 510 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 534 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.18 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 560 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1437  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 603 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0112279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 		 535 aa  100  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 595 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 		 569 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 559 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1506  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 604 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0138783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 512 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 512 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 512 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  23.44 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 631 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.68 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 567 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 529 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.56 
 
 		 524 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  23.93 
 
 		 501 aa  98.6  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.61 
 
 		 524 aa  97.8  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.17 
 
 		 529 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 531 aa  97.8  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 584 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.79 
 
 		 605 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.31 
 
 		 546 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>