More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 
572 aa  1164    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30 
 
 
563 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 
568 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
561 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 
547 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
568 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  27.96 
 
 
572 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.54 
 
 
551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 
553 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 
579 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 
627 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.25 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
559 aa  117  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
580 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
557 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
557 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 
562 aa  114  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 
565 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
531 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  23.29 
 
 
560 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
560 aa  107  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
597 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.57 
 
 
564 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.53 
 
 
556 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
548 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  23.09 
 
 
560 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 
560 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.34 
 
 
557 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.79 
 
 
562 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 
557 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 
548 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.83 
 
 
589 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  25.39 
 
 
577 aa  99.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.27 
 
 
588 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 
553 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
512 aa  97.1  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
569 aa  97.1  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.81 
 
 
587 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  23.66 
 
 
565 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
579 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
527 aa  95.1  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 
537 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25.25 
 
 
510 aa  94.4  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 
608 aa  93.6  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.18 
 
 
546 aa  93.6  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.1 
 
 
552 aa  92.8  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 
576 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.2 
 
 
524 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 
366 aa  91.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.57 
 
 
542 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
636 aa  91.3  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  25.07 
 
 
554 aa  89.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
510 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
566 aa  90.1  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.63 
 
 
545 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  21.93 
 
 
600 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2945  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 
565 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472455  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
551 aa  89.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
544 aa  89.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
517 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
559 aa  88.6  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
575 aa  88.2  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 
567 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
540 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.09 
 
 
540 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.32 
 
 
541 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 
512 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  26.45 
 
 
518 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
540 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.39 
 
 
575 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 
575 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
670 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
539 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 
631 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  24.68 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  24.67 
 
 
538 aa  85.1  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.43 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.19 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
531 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.05 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.67 
 
 
654 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
567 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.19 
 
 
575 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  26.73 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.25 
 
 
524 aa  84  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  30.81 
 
 
610 aa  84.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
554 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
586 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.88 
 
 
524 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.09 
 
 
542 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
581 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2501  extracellular solute-binding protein family 5  23.45 
 
 
613 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0677964  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 
575 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>