More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4132 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  59.62 
 
 		 631 aa  742    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  53.18 
 
 		 631 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 610 aa  1258    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  66.44 
 
 		 619 aa  829    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  53.63 
 
 		 638 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  90.33 
 
 		 610 aa  1158    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  51.96 
 
 		 659 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  51.91 
 
 		 631 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  50.08 
 
 		 614 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  50.87 
 
 		 605 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  50.77 
 
 		 631 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  50.09 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  48.82 
 
 		 617 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  49.04 
 
 		 641 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  48.54 
 
 		 641 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  48.87 
 
 		 670 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  48.7 
 
 		 637 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  48.87 
 
 		 637 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  48.96 
 
 		 621 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  47.16 
 
 		 622 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  47.16 
 
 		 622 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.52 
 
 		 610 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  44.46 
 
 		 622 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  45.93 
 
 		 609 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  45.1 
 
 		 600 aa  505  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  45.64 
 
 		 615 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  42.74 
 
 		 633 aa  485  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  42.58 
 
 		 603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  43.11 
 
 		 615 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  43.13 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  42.91 
 
 		 615 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  42.76 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  43.08 
 
 		 615 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  42.56 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  42.58 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  42.4 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  42.23 
 
 		 611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  41.81 
 
 		 613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.39 
 
 		 618 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  38.55 
 
 		 606 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 		 618 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  41.65 
 
 		 610 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  39.72 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  40.98 
 
 		 609 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  40.53 
 
 		 640 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  40.98 
 
 		 646 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  40.98 
 
 		 590 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  38.74 
 
 		 602 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  40.47 
 
 		 609 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.62 
 
 		 609 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  40.82 
 
 		 609 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  40.46 
 
 		 626 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.69 
 
 		 628 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  40.61 
 
 		 616 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  40.29 
 
 		 609 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  40.89 
 
 		 625 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  40.61 
 
 		 658 aa  411  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  39.52 
 
 		 626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  39.93 
 
 		 626 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  37.69 
 
 		 601 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  39.55 
 
 		 615 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 		 638 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.66 
 
 		 611 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  38.09 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 602 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  38.26 
 
 		 602 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  38.84 
 
 		 633 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 624 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 606 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  36.75 
 
 		 600 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  38.09 
 
 		 602 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  40.55 
 
 		 624 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 597 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  38.54 
 
 		 615 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.47 
 
 		 615 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.86 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.31 
 
 		 616 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 		 632 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  38.14 
 
 		 630 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 643 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 626 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 629 aa  379  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 625 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1412  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 		 623 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 621 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 		 592 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 		 628 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  38.66 
 
 		 621 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2050  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 		 620 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  37.06 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1037  ABC peptide transporter, periplasmic solute-binding protein  36.81 
 
 		 610 aa  368  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.490346  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 602 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0931  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2773  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 600 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2359  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 645 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0844875  normal  0.182874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  36.41 
 
 		 601 aa  364  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1433  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 610 aa  364  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.569191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0704  ABC peptide transporter, substrate binding protein  36.2 
 
 		 645 aa  363  6e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>