More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  74.29 
 
 		 609 aa  939    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.86 
 
 		 609 aa  967    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  76.35 
 
 		 609 aa  970    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  75.04 
 
 		 590 aa  939    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  77.1 
 
 		 610 aa  966    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  76.72 
 
 		 609 aa  969    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  78.62 
 
 		 616 aa  984    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  73.28 
 
 		 609 aa  929    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  97.7 
 
 		 626 aa  1221    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  74.29 
 
 		 646 aa  939    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  100 
 
 		 609 aa  1248    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  49.5 
 
 		 633 aa  567  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  47.63 
 
 		 615 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  47.42 
 
 		 600 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 		 613 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  46.55 
 
 		 603 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.01 
 
 		 618 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  44.83 
 
 		 618 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  44.3 
 
 		 611 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  45.98 
 
 		 613 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  44.48 
 
 		 615 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  45.09 
 
 		 615 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  44.79 
 
 		 609 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  45.09 
 
 		 615 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 		 611 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  43.14 
 
 		 611 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  43.47 
 
 		 611 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  41.96 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  45.09 
 
 		 602 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  40.39 
 
 		 606 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  42.49 
 
 		 670 aa  475  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  41.08 
 
 		 622 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.56 
 
 		 610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.36 
 
 		 628 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  41.75 
 
 		 622 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  41.82 
 
 		 658 aa  465  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  41.22 
 
 		 611 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 597 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  41.53 
 
 		 626 aa  455  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  41.02 
 
 		 635 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 		 638 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  40.9 
 
 		 627 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0267  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  39.71 
 
 		 638 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 		 622 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  41.13 
 
 		 631 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3254  extracellular solute-binding protein  41.11 
 
 		 643 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 632 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 		 617 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.72 
 
 		 611 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 621 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  39.23 
 
 		 627 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.87 
 
 		 614 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  40.03 
 
 		 631 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 628 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 		 627 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 		 622 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3741  extracellular solute-binding protein  40.1 
 
 		 623 aa  428  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 659 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  41.45 
 
 		 619 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  40.27 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  40.72 
 
 		 617 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  41.02 
 
 		 621 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3814  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 		 650 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2713  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 608 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  38.98 
 
 		 625 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  40.1 
 
 		 610 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2646  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 		 599 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02107  predicted oligopeptide transporter subunit  38.61 
 
 		 604 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1480  extracellular solute-binding protein family 5  38.61 
 
 		 604 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  38.78 
 
 		 604 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  39.62 
 
 		 622 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02066  hypothetical protein  38.61 
 
 		 604 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  39.49 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2315  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  38.61 
 
 		 604 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  37.91 
 
 		 602 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 602 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 		 605 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.61 
 
 		 614 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1470  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 604 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000141163  normal  0.0234366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  39.33 
 
 		 626 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  37.91 
 
 		 602 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2475  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  38.61 
 
 		 604 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  40.29 
 
 		 610 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0781  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  38.52 
 
 		 604 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 		 615 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3315  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  38.69 
 
 		 604 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.644955  normal  0.133502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  39.86 
 
 		 637 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2453  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 601 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000003014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  39.35 
 
 		 628 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2410  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 601 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  38.95 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2567  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 601 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  37.54 
 
 		 602 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2365  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 601 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0436387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  38.88 
 
 		 621 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2456  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 601 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.64 
 
 		 615 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.81 
 
 		 616 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 627 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>